鳳蝶科是具有重要進化地位的蝴蝶支系,因其豐富的色彩和形態(tài)等多樣性,成為昆蟲生態(tài)與進化研究的熱門主題。記者19日從中國科學院昆明動物研究所獲悉,該所進化基因組學與基因起源研究組近日發(fā)布了中華碧鳳蝶染色體水平基因組。根據(jù)所構建的進化樹提示,這種美麗的物種起源于約5000萬年前。
蝴蝶自達爾文時代就作為研究物種適應性進化的重要類群之一,近幾年更被認為是研究形態(tài)遺傳、進化和發(fā)育的理想模型,已成為發(fā)育生物學、進化生物學、種群遺傳學、保護生物學和生態(tài)學等研究領域的重要模式生物之一。
李學燕副研究員介紹,研究組在2015年完成所有蝴蝶模式種金鳳蝶及其近緣種柑橘鳳蝶兩種鳳蝶基因組的基礎上,對廣泛分布在東亞、南亞以及東南亞并對體色進化及物種分化具有重要研究意義的碧鳳蝶進行了基因組研究。他們運用三代長讀長測序技術,結合高通量染色體構象捕獲技術,成功地組裝了碧鳳蝶染色體水平的基因組,共有29條常染色體和1條性染色體。這也是首個利用高通量染色體構象捕獲技術完成的染色體水平的蝴蝶基因組,其總長約為421.52Mb?;蚪M注釋的結果表明,這是所有已發(fā)表的蝴蝶基因組中重復序列最高的基因組,注釋到的蛋白編碼基因共15375個。
研究人員利用4D位點以及直系同源基因構建的進化樹還提示,鳳蝶屬起源于3900萬年前至5700萬年前之間,它與柑橘鳳蝶和金鳳蝶的分歧約在2000萬年前至3000萬年前間。對碧鳳蝶的歷史種群動態(tài)進行的分析結果顯示,碧鳳蝶種群從最近的一次間冰期開始增加,直至末次盛冰期為止,這與先前對其它昆蟲的研究結果一致。